JIA | 河南科技大学王春平教授课题组基于ND-FISH和SNP芯片对小麦背景中华山新麦草染色体的快速鉴定研究
该研究开发了华山新麦草染色体特异的寡核苷酸探针,通过与构建的华山新麦草FISH核型进行比较,研究者可以更容易地在小麦背景中区分华山新麦草染色体,并分析其对应的同源群。此外,该研究还分析了四种低密度SNP芯片在小麦-近缘种衍生系鉴定中的应用策略。研究结果有助于提高小麦远缘杂交后代的鉴定效率。
该研究开发了三个非变性荧光原位杂交 (ND-FISH) 探针。其中,HS-TZ3和HS-TZ4能与华山新麦草染色体特异杂交,信号主要集中在端粒区;HS-CHTZ5能与染色体的着丝粒区特异性杂交。并据此依次构建了华山新麦草七个同源群染色体的FISH核型图和模式图,有助于鉴定导入的外源染色体所属同源群。其中,1Ns和2Ns在短臂和长臂上有相反的信号,3Ns、4Ns和7Ns有重叠的双色信号,5Ns和6Ns仅在短臂有荧光信号,7Ns在长臂中间区域有荧光信号。通过比较低密度SNP芯片鉴定外源渗入系的差异,推荐将每条染色体上SNP位点的纯合率作为统计模式用于分析。其中15K SNP芯片广泛适用于附加系、代换系和易位系,40K SNP芯片能更准确地识别小麦-外源重组染色体易位发生的区段。
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https://doi.org/10.1016/j.jia.2023.02.001
Cite the article:
LI Jia-chuang, LI Jiao-jiao, ZHAO Li, ZHAO Ji-xin, WU Jun, CHEN Xin-hong, ZHANG Li-yu, DONG Pu-hui, WANG Li-ming, ZHAO De-hui, WANG Chun-ping, PANG Yu-hui. 2023. Rapid identification of Psathyrostachys huashanica Keng chromosomes in wheat background based on ND-FISH and SNP array methods. Journal of Integrative Agriculture, 22(10): 2934-2948.
研究团队简介
河南科技大学农学院小麦种质创制与分子育种研究团队
王春平教授(第1排左起第5位)
河南科技大学农学院小麦种质创制与分子育种研究团队由王春平教授领衔,长期致力于小麦遗传育种和种子工程研究,在小麦种质创制与基因挖掘、小麦分子育种与种子工程等方面做了大量的工作,发掘了具有较大遗传效应的基因位点20余个,开发了优异等位基因分子标记16个,开创了抗性和营养健康资源挖掘新途径,取得了一系列具有重要应用价值的原创性成果,为小麦抗性和营养保健奠定了重要分子理论基础,制定了以四级程序为基础的12种作物30项河南省地方标准。近年来,王春平教授先后承担神农种业实验室一流课题项目“优质基因编辑与转基因小麦新种质创制”、国家“十三五”重点研发专项子课题、国家精品在线课程建设、河南省重大科技专项、自然科学基金、国际合作等研究项目16项,获全国农牧渔业丰收一等奖1项、全国农林院校种艺作品大赛“三等奖”1项和其他省市级科技成果奖6项,选育新品种4个,发明专利4项,出版著作12部,在国内外期刊上发表学术论文105篇,其中SCI收录35篇。
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